基于APEX技术的空间特异性蛋白质组和转录组研究

报告时间:2019年5月23日(星期四)上午9:30

报告地点:会议中心一号会议室

报告人:邹鹏特聘研究员,北京大学化学与分子工程学院

  报告摘要:

  近些年来,通过邻近标记技术对于蛋白质-蛋白质相互作用的研究日益广泛,例如基于APEX2酶的生物素标记技术在许多具有挑战性的生物领域能够提供相关蛋白质组谱图信息。APEX2酶能够在过氧化氢的作用下,将其底物生物素-苯酚(BP)共价结合到附近的蛋白质上,经由进一步的富集和纯化从而得到感兴趣的蛋白质组信息。酵母细胞由于其较短的传代周期和相对明晰的基因组组成,是一种被广泛研究和使用的模式生物。然而尽管在哺乳动物中应用广泛,目前仍然缺少在酵母体系中的APEX2标记研究。由于酵母细胞壁的存在,使得APEX2的底物生物素苯酚难以进入细胞,从而完成生物素的标记。为此,我们设计并合成了新一代APEX2底物炔基苯酚(AP)探针,相比于BP,AP具有更小的体积,更容易透过细胞壁。在完成酵母细胞内的APEX2标记后,通过点击化学将AP探针中末端炔基与叠氮基生物素结合,实现被标记蛋白的生物素化。我们将这一方法应用于研究酵母细胞中的亚细胞区域蛋白质组,并进一步发展了针对标记位点的鉴定方法,以此识别膜蛋白拓扑结构。通过对APEX2底物的进一步筛选,我们还发现了能够高效标记核酸的新型探针,将APEX技术的应用由蛋白质组领域扩展到转录组。

  报告人简介:

  邹鹏特聘研究员于2007年在北京大学获得化学、物理双学士学位;2012年在麻省理工学院化学系获得理学博士学位,师从Alice Ting教授;2013年-2015年在哈佛大学化学与化学生物学系做博士后研究员,师从Adam Cohen教授,2015年至今担任北京大学化学与分子工程学院,北京大学合成与功能生物分子中心,北大-清华生命科学联合中心,北大IDG/麦戈文脑科学研究所特聘研究员。曾在Stem Cell Reports, ACS. Chem. Neurosci, Angew. Chem. Int. Ed. Engl, Sci. Adv., Chin. Chem. Lett.等杂志以通讯作者身份发表文章。 主要研究方向:发展可遗传编码的荧光膜电位探针,实现对神经细胞动作电位的高时空分辨观测;研究与神经退行性疾病相关的RNA颗粒的结构与功能;发展蛋白质标记技术,研究参与记忆形成过程的局部蛋白质合成途径。

  联系人:1810组 张丽华

  联系电话:84379720

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