蛋白质组海量质谱数据的深度解析

  报告时间:2013103109:00

  报告地点:能源楼一号楼1号会议室

  报告题目:蛋白质组海量质谱数据的深度解析

  报告人:贺思敏

  中国科学院计算技术研究所研究员、博士生导师。

  报告人简介:

  1997年毕业于清华大学计算机科学与技术系。近十年研究方向为计算蛋白质组学,专注于蛋白质组海量质谱数据的深度解析,带领团队完成了具有完全自主知识产权的规模化蛋白质鉴定的数据库搜索引擎pFind、从头测序引擎pNovo和交联鉴定引擎pLinkpFind引擎连续三年在美国ABRF iPRG蛋白质鉴定国际评测中表现出色,并成功用于核心岩藻糖化蛋白质的规模化鉴定,合作研究论文发表在MCPpNovo引擎在多种酶切肽段的高精度HCD谱图、ETD谱图单独或联用条件下的从头测序精度和速度均达到当前国际最佳水平,并成功用于线虫纲精细胞活化与精子竞争机制研究中两个关键蛋白因子的测序,合作研究论文发表在PNASpLink引擎在国际上首次实现了常规实验条件下复杂样品交联肽段的规模化鉴定及其质量控制,合作研究论文发表在Nature Methods并受到专题评论。pFind团队与国内蛋白质组学团队开展了广泛而深入的交叉合作研究,倡议并主办了第一届、第二届中国计算蛋白质组学研讨会。

  报告摘要:

  蛋白质组学的发展始终受到串联质谱数据解析率低的困扰,而近年来以高精度串联质谱数据为基础的精密蛋白质组学有望摆脱这一困扰。本报告以德国马普生化研究所Mann实验室的蛋白质组学数据为对象,以MaxQuantpFind系列软件为工具,分析了当前高质量的高精度串联质谱数据的解析率,分析了过去低精度串联质谱数据解析率低的原因,分析了未来获得更高解析率的途径和可能,最终乐观预测蛋白质组学的数据分析瓶颈即将被打破。

  报告联系人:1810张丽华9720  

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